ה״יוזמה – מרכז לידע ולמחקר בחינוך״ הוקמה בשנת 2003 ביוזמת נשיא האקדמיה הלאומית הישראלית למדעים דאז פרופ' מנחם יערי, כמיזם משותף של האקדמיה, משרד החינוך ויד הנדיב. היוזמה פעלה לקידום מערכת החינוך בישראל באמצעות הנגשת ידע מבוסס מחקר בתחום והגברת השימוש בו בתהליכי עיצוב מדיניות וקבלת החלטות. החל משנת 2010 פעלה היוזמה כיחידה של האקדמיה.
היוזמה פעלה בהנחייתה של ועדת היגוי שמינה נשיא האקדמיה. ועדת ההיגוי התוותה את קווי הפעולה של היוזמה, אישרה את הנושאים שעסקה בהם והייתה אחראית לתהליכי השיפוט של תוצרי הפעילויות.
היוזמה פעלה במספר ערוצים, ובהם ועדות מומחים רב-תחומיות לבדיקת סוגיות מהותיות שהעסיקו את מערכת החינוך, קבוצות עבודה משותפות לחוקרים ולאנשי מטה ושטח במערכת וכן עיבוד והנגשה של ידע מחקרי. תוצרי הפעילויות פורסמו לקהל הרחב והונגשו לקהלי יעד שונים.
בשנת 2023, עם הקמת האגף לייעוץ וקשרי ממשל באקדמיה, הממונה על הגשמת תפקידה של האקדמיה לפי חוק לייעץ לממשלה בעניינים בעלי חשיבות לאומית של מחקר ותכנון מדעי, התאחדה היוזמה עם אגף זה באקדמיה.